Finpesca asegura la trazabilidad de todos los productos que comercializa con arreglo a las normas de seguridad alimentaria, a través de un sistema informatizado de atribución y lectura del número de lote. Una vez superados los rigurosos controles de calidad de entrada, cada partida recibe un código de barras que se puede identificar a lo largo de la cadena por medio de lectores ópticos portátiles.
Gracias a sofisticadas técnicas analíticas los productos de Finpesca se mantienen frescos y no pierden ninguna de sus propiedades características. Otra garantía tanto para el cliente como para el consumidor final es la Certificación de Calidad ISO 9002, conquistada por Finpesca en 2001.